Skip to content

EpiGraphDB metadata and metrics

Meta node

Meta node count
Disease 21,829
Drug 2,455
Efo 25,390
Event 11,868
Gene 59,171
Gwas 31,773
Literature 29,137,785
Pathway 2,180
Protein 21,543
SemmedTerm 103,967
SemmedTriple 3,428,531
Tissue 53
Variant 88,176

Meta relationship

Meta rel from_node to_node count
MONDO_MAP_EFO Disease Efo 2,822
MONDO_MAP_UMLS Disease SemmedTerm 3,414
OPENTARGETS_DRUG_TO_DISEASE Drug Disease 2,486
CPIC Drug Gene 355
OPENTARGETS_DRUG_TO_TARGET Drug Gene 6,024
EFO_CHILD_OF Efo Efo 43,154
PRECEDING_EVENT Event Event 10,418
XQTL_MULTI_SNP_MR Gene Gwas 3,098,049
XQTL_SINGLE_SNP_MR_GENE_GWAS Gene Gwas 8,703,863
GENE_TO_LITERATURE Gene Literature 771
INTACT_INTERACTS_WITH_GENE_PROTEIN Gene Protein 1,451
GENE_TO_PROTEIN Gene Protein 20,762
EXPRESSED_IN Gene Tissue 861,552
GWAS_NLP_EFO Gwas Efo 6,936
PRS Gwas Gwas 132,703
OBS_COR Gwas Gwas 17,932
GWAS_NLP Gwas Gwas 30,838,964
MR Gwas Gwas 583,619
BN_GEN_COR Gwas Gwas 904,832
GWAS_TO_LIT Gwas Literature 19,079,468
METAMAP_LITE Gwas SemmedTerm 2,081
GWAS_SEM Gwas SemmedTriple 9,075,020
TOPHITS Gwas Variant 122,730
GWAS_TO_VARIANT Gwas Variant 26,521
PATHWAY_TO_DISEASE Pathway Disease 541
EVENT_IN_PATHWAY Pathway Event 12,488
PATHWAY_TO_LITERATURE Pathway Literature 8,952
PROTEIN_TO_DISEASE Protein Disease 626
PROTEIN_IN_EVENT Protein Event 13,484
PROTEIN_TO_LITERATURE Protein Literature 107,315
PROTEIN_IN_PATHWAY Protein Pathway 9,955
INTACT_INTERACTS_WITH_PROTEIN_PROTEIN Protein Protein 187,426
STRING_INTERACT_WITH Protein Protein 390,222
INTACT_NOT_INTERACTS_WITH Protein Protein 699
SEM_GENE SemmedTerm Gene 41,706
SEM_PREDICATE SemmedTerm SemmedTerm 3,428,531
SEM_TO_LIT SemmedTriple Literature 6,127,985
SEM_SUB SemmedTriple SemmedTerm 3,428,531
SEM_OBJ SemmedTriple SemmedTerm 3,428,531
XQTL_SINGLE_SNP_MR_SNP_GENE Variant Gene 41,564
VARIANT_TO_GENE Variant Gene 59,157

Metadata

Expand to show
 {'connections': [{'count': 2486,
                   'from_node': 'Drug',
                   'rel': 'OPENTARGETS_DRUG_TO_DISEASE',
                   'to_node': 'Disease'},
                  {'count': 3414,
                   'from_node': 'Disease',
                   'rel': 'MONDO_MAP_UMLS',
                   'to_node': 'SemmedTerm'},
                  {'count': 626,
                   'from_node': 'Protein',
                   'rel': 'PROTEIN_TO_DISEASE',
                   'to_node': 'Disease'},
                  {'count': 2822,
                   'from_node': 'Disease',
                   'rel': 'MONDO_MAP_EFO',
                   'to_node': 'Efo'},
                  {'count': 541,
                   'from_node': 'Pathway',
                   'rel': 'PATHWAY_TO_DISEASE',
                   'to_node': 'Disease'},
                  {'count': 41706,
                   'from_node': 'SemmedTerm',
                   'rel': 'SEM_GENE',
                   'to_node': 'Gene'},
                  {'count': 3428531,
                   'from_node': 'SemmedTriple',
                   'rel': 'SEM_SUB',
                   'to_node': 'SemmedTerm'},
                  {'count': 2081,
                   'from_node': 'Gwas',
                   'rel': 'METAMAP_LITE',
                   'to_node': 'SemmedTerm'},
                  {'count': 3428531,
                   'from_node': 'SemmedTerm',
                   'rel': 'SEM_PREDICATE',
                   'to_node': 'SemmedTerm'},
                  {'count': 3428531,
                   'from_node': 'SemmedTriple',
                   'rel': 'SEM_OBJ',
                   'to_node': 'SemmedTerm'},
                  {'count': 12488,
                   'from_node': 'Pathway',
                   'rel': 'EVENT_IN_PATHWAY',
                   'to_node': 'Event'},
                  {'count': 9955,
                   'from_node': 'Protein',
                   'rel': 'PROTEIN_IN_PATHWAY',
                   'to_node': 'Pathway'},
                  {'count': 8952,
                   'from_node': 'Pathway',
                   'rel': 'PATHWAY_TO_LITERATURE',
                   'to_node': 'Literature'},
                  {'count': 1451,
                   'from_node': 'Gene',
                   'rel': 'INTACT_INTERACTS_WITH_GENE_PROTEIN',
                   'to_node': 'Protein'},
                  {'count': 771,
                   'from_node': 'Gene',
                   'rel': 'GENE_TO_LITERATURE',
                   'to_node': 'Literature'},
                  {'count': 8703863,
                   'from_node': 'Gene',
                   'rel': 'XQTL_SINGLE_SNP_MR_GENE_GWAS',
                   'to_node': 'Gwas'},
                  {'count': 861552,
                   'from_node': 'Gene',
                   'rel': 'EXPRESSED_IN',
                   'to_node': 'Tissue'},
                  {'count': 355,
                   'from_node': 'Drug',
                   'rel': 'CPIC',
                   'to_node': 'Gene'},
                  {'count': 6024,
                   'from_node': 'Drug',
                   'rel': 'OPENTARGETS_DRUG_TO_TARGET',
                   'to_node': 'Gene'},
                  {'count': 3098049,
                   'from_node': 'Gene',
                   'rel': 'XQTL_MULTI_SNP_MR',
                   'to_node': 'Gwas'},
                  {'count': 41564,
                   'from_node': 'Variant',
                   'rel': 'XQTL_SINGLE_SNP_MR_SNP_GENE',
                   'to_node': 'Gene'},
                  {'count': 20762,
                   'from_node': 'Gene',
                   'rel': 'GENE_TO_PROTEIN',
                   'to_node': 'Protein'},
                  {'count': 59157,
                   'from_node': 'Variant',
                   'rel': 'VARIANT_TO_GENE',
                   'to_node': 'Gene'},
                  {'count': 19079468,
                   'from_node': 'Gwas',
                   'rel': 'GWAS_TO_LIT',
                   'to_node': 'Literature'},
                  {'count': 107315,
                   'from_node': 'Protein',
                   'rel': 'PROTEIN_TO_LITERATURE',
                   'to_node': 'Literature'},
                  {'count': 6127985,
                   'from_node': 'SemmedTriple',
                   'rel': 'SEM_TO_LIT',
                   'to_node': 'Literature'},
                  {'count': 187426,
                   'from_node': 'Protein',
                   'rel': 'INTACT_INTERACTS_WITH_PROTEIN_PROTEIN',
                   'to_node': 'Protein'},
                  {'count': 13484,
                   'from_node': 'Protein',
                   'rel': 'PROTEIN_IN_EVENT',
                   'to_node': 'Event'},
                  {'count': 390222,
                   'from_node': 'Protein',
                   'rel': 'STRING_INTERACT_WITH',
                   'to_node': 'Protein'},
                  {'count': 699,
                   'from_node': 'Protein',
                   'rel': 'INTACT_NOT_INTERACTS_WITH',
                   'to_node': 'Protein'},
                  {'count': 26521,
                   'from_node': 'Gwas',
                   'rel': 'GWAS_TO_VARIANT',
                   'to_node': 'Variant'},
                  {'count': 122730,
                   'from_node': 'Gwas',
                   'rel': 'TOPHITS',
                   'to_node': 'Variant'},
                  {'count': 9075020,
                   'from_node': 'Gwas',
                   'rel': 'GWAS_SEM',
                   'to_node': 'SemmedTriple'},
                  {'count': 6936,
                   'from_node': 'Gwas',
                   'rel': 'GWAS_NLP_EFO',
                   'to_node': 'Efo'},
                  {'count': 43154,
                   'from_node': 'Efo',
                   'rel': 'EFO_CHILD_OF',
                   'to_node': 'Efo'},
                  {'count': 583619,
                   'from_node': 'Gwas',
                   'rel': 'MR',
                   'to_node': 'Gwas'},
                  {'count': 904832,
                   'from_node': 'Gwas',
                   'rel': 'BN_GEN_COR',
                   'to_node': 'Gwas'},
                  {'count': 17932,
                   'from_node': 'Gwas',
                   'rel': 'OBS_COR',
                   'to_node': 'Gwas'},
                  {'count': 30838964,
                   'from_node': 'Gwas',
                   'rel': 'GWAS_NLP',
                   'to_node': 'Gwas'},
                  {'count': 132703,
                   'from_node': 'Gwas',
                   'rel': 'PRS',
                   'to_node': 'Gwas'},
                  {'count': 10418,
                   'from_node': 'Event',
                   'rel': 'PRECEDING_EVENT',
                   'to_node': 'Event'}],
  'edges': {'BN_GEN_COR': {'count': 904832,
                           'properties': {'gcov_int': {'array': False,
                                                       'type': 'FLOAT'},
                                          'gcov_int_se': {'array': False,
                                                          'type': 'FLOAT'},
                                          'h2_int': {'array': False,
                                                     'type': 'FLOAT'},
                                          'h2_int_se': {'array': False,
                                                        'type': 'FLOAT'},
                                          'h2_obs': {'array': False,
                                                     'type': 'FLOAT'},
                                          'h2_obs_se': {'array': False,
                                                        'type': 'FLOAT'},
                                          'p': {'array': False, 'type': 'FLOAT'},
                                          'rg': {'array': False,
                                                 'type': 'FLOAT'},
                                          'se': {'array': False,
                                                 'type': 'FLOAT'},
                                          'z': {'array': False,
                                                'type': 'FLOAT'}}},
            'CPIC': {'count': 355,
                     'properties': {'cpic_level': {'array': False,
                                                   'type': 'STRING'},
                                    'guideline': {'array': False,
                                                  'type': 'STRING'},
                                    'pgx_on_fda_label': {'array': False,
                                                         'type': 'STRING'},
                                    'pharmgkb_level_of_evidence': {'array': False,
                                                                   'type': 'STRING'}}},
            'EFO_CHILD_OF': {'count': 43154, 'properties': None},
            'EVENT_IN_PATHWAY': {'count': 12488, 'properties': None},
            'EXPRESSED_IN': {'count': 861552,
                             'properties': {'tpm': {'array': False,
                                                    'type': 'FLOAT'}}},
            'GENE_TO_LITERATURE': {'count': 771, 'properties': None},
            'GENE_TO_PROTEIN': {'count': 20762, 'properties': None},
            'GWAS_NLP': {'count': 30838964,
                         'properties': {'score': {'array': False,
                                                  'type': 'FLOAT'}}},
            'GWAS_NLP_EFO': {'count': 6936,
                             'properties': {'score': {'array': False,
                                                      'type': 'FLOAT'}}},
            'GWAS_SEM': {'count': 9075020,
                         'properties': {'globalCount': {'array': False,
                                                        'type': 'INTEGER'},
                                        'globalTotal': {'array': False,
                                                        'type': 'INTEGER'},
                                        'localCount': {'array': False,
                                                       'type': 'INTEGER'},
                                        'localTotal': {'array': False,
                                                       'type': 'INTEGER'},
                                        'odds': {'array': False,
                                                 'type': 'FLOAT'},
                                        'pval': {'array': False,
                                                 'type': 'FLOAT'}}},
            'GWAS_TO_LIT': {'count': 19079468, 'properties': None},
            'GWAS_TO_VARIANT': {'count': 26521,
                                'properties': {'beta': {'array': False,
                                                        'type': 'FLOAT'},
                                               'eaf': {'array': False,
                                                       'type': 'FLOAT'},
                                               'ncase': {'array': False,
                                                         'type': 'INTEGER'},
                                               'ncontrol': {'array': False,
                                                            'type': 'INTEGER'},
                                               'pval': {'array': False,
                                                        'type': 'FLOAT'},
                                               'samplesize': {'array': False,
                                                              'type': 'INTEGER'},
                                               'se': {'array': False,
                                                      'type': 'FLOAT'}}},
            'INTACT_INTERACTS_WITH_GENE_GENE': {'count': 2, 'properties': None},
            'INTACT_INTERACTS_WITH_GENE_PROTEIN': {'count': 1451,
                                                   'properties': {'intact_confidence_score': {'array': False,
                                                                                              'type': 'FLOAT'},
                                                                  'intact_detection_method': {'array': True,
                                                                                              'type': 'LIST'},
                                                                  'intact_identifier': {'array': True,
                                                                                        'type': 'LIST'},
                                                                  'intact_source': {'array': True,
                                                                                    'type': 'LIST'},
                                                                  'intact_type': {'array': True,
                                                                                  'type': 'LIST'}}},
            'INTACT_INTERACTS_WITH_PROTEIN_PROTEIN': {'count': 187426,
                                                      'properties': {'intact_confidence_score': {'array': False,
                                                                                                 'type': 'FLOAT'},
                                                                     'intact_detection_method': {'array': True,
                                                                                                 'type': 'LIST'},
                                                                     'intact_identifier': {'array': True,
                                                                                           'type': 'LIST'},
                                                                     'intact_source': {'array': True,
                                                                                       'type': 'LIST'},
                                                                     'intact_type': {'array': True,
                                                                                     'type': 'LIST'}}},
            'INTACT_NOT_INTERACTS_WITH': {'count': 699,
                                          'properties': {'intact_confidence_score': {'array': False,
                                                                                     'type': 'FLOAT'},
                                                         'intact_detection_method': {'array': True,
                                                                                     'type': 'LIST'},
                                                         'intact_identifier': {'array': True,
                                                                               'type': 'LIST'},
                                                         'intact_source': {'array': True,
                                                                           'type': 'LIST'},
                                                         'intact_type': {'array': True,
                                                                         'type': 'LIST'}}},
            'METAMAP_LITE': {'count': 2081,
                             'properties': {'mmi_score': {'array': False,
                                                          'type': 'FLOAT'}}},
            'MONDO_MAP_EFO': {'count': 2822, 'properties': None},
            'MONDO_MAP_UMLS': {'count': 3414, 'properties': None},
            'MR': {'count': 583619,
                   'properties': {'b': {'array': False, 'type': 'FLOAT'},
                                  'ci_low': {'array': False, 'type': 'FLOAT'},
                                  'ci_upp': {'array': False, 'type': 'FLOAT'},
                                  'log10pval': {'array': False, 'type': 'FLOAT'},
                                  'method': {'array': False, 'type': 'STRING'},
                                  'moescore': {'array': False, 'type': 'FLOAT'},
                                  'nsnp': {'array': False, 'type': 'INTEGER'},
                                  'pval': {'array': False, 'type': 'FLOAT'},
                                  'se': {'array': False, 'type': 'FLOAT'},
                                  'selection': {'array': False,
                                                'type': 'STRING'}}},
            'OBS_COR': {'count': 17932,
                        'properties': {'cor': {'array': False,
                                               'type': 'FLOAT'}}},
            'OPENTARGETS_DRUG_TO_DISEASE': {'count': 2486, 'properties': None},
            'OPENTARGETS_DRUG_TO_TARGET': {'count': 6024,
                                           'properties': {'action_type': {'array': False,
                                                                          'type': 'STRING'},
                                                          'phase': {'array': False,
                                                                    'type': 'STRING'}}},
            'PATHWAY_TO_DISEASE': {'count': 541, 'properties': None},
            'PATHWAY_TO_LITERATURE': {'count': 8952, 'properties': None},
            'PRECEDING_EVENT': {'count': 10418, 'properties': None},
            'PROTEIN_IN_EVENT': {'count': 13484, 'properties': None},
            'PROTEIN_IN_PATHWAY': {'count': 9955, 'properties': None},
            'PROTEIN_TO_DISEASE': {'count': 626, 'properties': None},
            'PROTEIN_TO_LITERATURE': {'count': 107315, 'properties': None},
            'PRS': {'count': 132703,
                    'properties': {'beta': {'array': False, 'type': 'FLOAT'},
                                   'model': {'array': False, 'type': 'STRING'},
                                   'n': {'array': False, 'type': 'INTEGER'},
                                   'nsnps': {'array': False, 'type': 'INTEGER'},
                                   'p': {'array': False, 'type': 'FLOAT'},
                                   'r2': {'array': False, 'type': 'FLOAT'},
                                   'se': {'array': False, 'type': 'FLOAT'}}},
            'SEM_GENE': {'count': 41706, 'properties': None},
            'SEM_OBJ': {'count': 3428531, 'properties': None},
            'SEM_PREDICATE': {'count': 3428531,
                              'properties': {'count': {'array': False,
                                                       'type': 'INTEGER'},
                                             'predicate': {'array': False,
                                                           'type': 'STRING'}}},
            'SEM_SUB': {'count': 3428531, 'properties': None},
            'SEM_TO_LIT': {'count': 6127985, 'properties': None},
            'STRING_INTERACT_WITH': {'count': 390222,
                                     'properties': {'score': {'array': False,
                                                              'type': 'INTEGER'}}},
            'TOPHITS': {'count': 122730,
                        'properties': {'beta': {'array': False,
                                                'type': 'STRING'},
                                       'pval': {'array': False,
                                                'type': 'FLOAT'}}},
            'VARIANT_TO_GENE': {'count': 59157,
                                'properties': {'allele': {'array': False,
                                                          'type': 'STRING'},
                                               'amino_acids': {'array': False,
                                                               'type': 'STRING'},
                                               'cdna_position': {'array': False,
                                                                 'type': 'STRING'},
                                               'cds_position': {'array': False,
                                                                'type': 'STRING'},
                                               'codons': {'array': False,
                                                          'type': 'STRING'},
                                               'consequence': {'array': False,
                                                               'type': 'STRING'},
                                               'existing_variation': {'array': False,
                                                                      'type': 'STRING'},
                                               'extra': {'array': False,
                                                         'type': 'STRING'},
                                               'feature': {'array': False,
                                                           'type': 'STRING'},
                                               'feature_type': {'array': False,
                                                                'type': 'STRING'},
                                               'location': {'array': False,
                                                            'type': 'STRING'},
                                               'protein_position': {'array': False,
                                                                    'type': 'STRING'}}},
            'XQTL_MULTI_SNP_MR': {'count': 3098049,
                                  'properties': {'beta': {'array': False,
                                                          'type': 'FLOAT'},
                                                 'mr_method': {'array': False,
                                                               'type': 'STRING'},
                                                 'p': {'array': False,
                                                       'type': 'FLOAT'},
                                                 'qtl_type': {'array': False,
                                                              'type': 'STRING'},
                                                 'se': {'array': False,
                                                        'type': 'FLOAT'}}},
            'XQTL_SINGLE_SNP_MR_GENE_GWAS': {'count': 8703863,
                                             'properties': {'beta': {'array': False,
                                                                     'type': 'FLOAT'},
                                                            'p': {'array': False,
                                                                  'type': 'FLOAT'},
                                                            'qtl_type': {'array': False,
                                                                         'type': 'STRING'},
                                                            'rsid': {'array': False,
                                                                     'type': 'STRING'},
                                                            'se': {'array': False,
                                                                   'type': 'FLOAT'}}},
            'XQTL_SINGLE_SNP_MR_SNP_GENE': {'count': 41564, 'properties': None}},
  'nodes': {'Disease': {'count': 21829,
                        'properties': {'definition': {'indexed': False,
                                                      'type': 'STRING',
                                                      'unique': False},
                                       'doid': {'indexed': False,
                                                'type': 'LIST',
                                                'unique': False},
                                       'efo': {'indexed': False,
                                               'type': 'LIST',
                                               'unique': False},
                                       'icd10': {'indexed': False,
                                                 'type': 'LIST',
                                                 'unique': False},
                                       'icd9': {'indexed': False,
                                                'type': 'LIST',
                                                'unique': False},
                                       'id': {'indexed': True,
                                              'type': 'STRING',
                                              'unique': True},
                                       'label': {'indexed': False,
                                                 'type': 'STRING',
                                                 'unique': False},
                                       'mesh': {'indexed': False,
                                                'type': 'LIST',
                                                'unique': False},
                                       'umls': {'indexed': False,
                                                'type': 'LIST',
                                                'unique': False}}},
            'Drug': {'count': 2455,
                     'properties': {'chembl_uri': {'indexed': False,
                                                   'type': 'STRING',
                                                   'unique': False},
                                    'label': {'indexed': True,
                                              'type': 'STRING',
                                              'unique': False},
                                    'molecule_type': {'indexed': False,
                                                      'type': 'STRING',
                                                      'unique': False},
                                    'source': {'indexed': False,
                                               'type': 'LIST',
                                               'unique': False}}},
            'Efo': {'count': 25390,
                    'properties': {'id': {'indexed': True,
                                          'type': 'STRING',
                                          'unique': True},
                                   'type': {'indexed': False,
                                            'type': 'STRING',
                                            'unique': False},
                                   'value': {'indexed': False,
                                             'type': 'STRING',
                                             'unique': False}}},
            'Event': {'count': 11868,
                      'properties': {'in_disease': {'indexed': False,
                                                    'type': 'STRING',
                                                    'unique': False},
                                     'name': {'indexed': False,
                                              'type': 'STRING',
                                              'unique': False},
                                     'reactome_id': {'indexed': True,
                                                     'type': 'STRING',
                                                     'unique': True}}},
            'Gene': {'count': 59171,
                     'properties': {'adme_gene': {'indexed': False,
                                                  'type': 'STRING',
                                                  'unique': False},
                                    'bio_druggable': {'indexed': False,
                                                      'type': 'STRING',
                                                      'unique': False},
                                    'chr': {'indexed': True,
                                            'type': 'STRING',
                                            'unique': False},
                                    'description': {'indexed': False,
                                                    'type': 'STRING',
                                                    'unique': False},
                                    'druggability_tier': {'indexed': True,
                                                          'type': 'STRING',
                                                          'unique': False},
                                    'end': {'indexed': False,
                                            'type': 'INTEGER',
                                            'unique': False},
                                    'ensembl_id': {'indexed': True,
                                                   'type': 'STRING',
                                                   'unique': True},
                                    'name': {'indexed': True,
                                             'type': 'STRING',
                                             'unique': False},
                                    'reactome_id': {'indexed': False,
                                                    'type': 'STRING',
                                                    'unique': False},
                                    'small_mol_druggable': {'indexed': False,
                                                            'type': 'STRING',
                                                            'unique': False},
                                    'source': {'indexed': False,
                                               'type': 'STRING',
                                               'unique': False},
                                    'start': {'indexed': False,
                                              'type': 'INTEGER',
                                              'unique': False},
                                    'type': {'indexed': False,
                                             'type': 'STRING',
                                             'unique': False}}},
            'Gwas': {'count': 31773,
                     'properties': {'access': {'indexed': False,
                                               'type': 'STRING',
                                               'unique': False},
                                    'author': {'indexed': False,
                                               'type': 'STRING',
                                               'unique': False},
                                    'category': {'indexed': False,
                                                 'type': 'STRING',
                                                 'unique': False},
                                    'consortium': {'indexed': False,
                                                   'type': 'STRING',
                                                   'unique': False},
                                    'id': {'indexed': True,
                                           'type': 'STRING',
                                           'unique': True},
                                    'mr': {'indexed': False,
                                           'type': 'STRING',
                                           'unique': False},
                                    'ncase': {'indexed': False,
                                              'type': 'STRING',
                                              'unique': False},
                                    'ncontrol': {'indexed': False,
                                                 'type': 'STRING',
                                                 'unique': False},
                                    'note': {'indexed': False,
                                             'type': 'STRING',
                                             'unique': False},
                                    'nsnp': {'indexed': False,
                                             'type': 'STRING',
                                             'unique': False},
                                    'pmid': {'indexed': False,
                                             'type': 'STRING',
                                             'unique': False},
                                    'population': {'indexed': False,
                                                   'type': 'STRING',
                                                   'unique': False},
                                    'priority': {'indexed': False,
                                                 'type': 'STRING',
                                                 'unique': False},
                                    'sample_size': {'indexed': False,
                                                    'type': 'STRING',
                                                    'unique': False},
                                    'sd': {'indexed': False,
                                           'type': 'STRING',
                                           'unique': False},
                                    'sex': {'indexed': False,
                                            'type': 'STRING',
                                            'unique': False},
                                    'subcategory': {'indexed': False,
                                                    'type': 'STRING',
                                                    'unique': False},
                                    'trait': {'indexed': True,
                                              'type': 'STRING',
                                              'unique': False},
                                    'unit': {'indexed': False,
                                             'type': 'STRING',
                                             'unique': False},
                                    'year': {'indexed': False,
                                             'type': 'STRING',
                                             'unique': False}}},
            'Literature': {'count': 29137785,
                           'properties': {'dp': {'indexed': False,
                                                 'type': 'STRING',
                                                 'unique': False},
                                          'edat': {'indexed': False,
                                                   'type': 'STRING',
                                                   'unique': False},
                                          'issn': {'indexed': False,
                                                   'type': 'STRING',
                                                   'unique': False},
                                          'pubmed_id': {'indexed': True,
                                                        'type': 'STRING',
                                                        'unique': True},
                                          'year': {'indexed': True,
                                                   'type': 'INTEGER',
                                                   'unique': False}}},
            'Pathway': {'count': 2180,
                        'properties': {'in_disease': {'indexed': False,
                                                      'type': 'STRING',
                                                      'unique': False},
                                       'name': {'indexed': False,
                                                'type': 'STRING',
                                                'unique': False},
                                       'reactome_id': {'indexed': True,
                                                       'type': 'STRING',
                                                       'unique': True}}},
            'Protein': {'count': 21543,
                        'properties': {'uniprot_id': {'indexed': True,
                                                      'type': 'STRING',
                                                      'unique': True}}},
            'SemmedTerm': {'count': 103967,
                           'properties': {'count': {'indexed': False,
                                                    'type': 'INTEGER',
                                                    'unique': False},
                                          'id': {'indexed': True,
                                                 'type': 'STRING',
                                                 'unique': True},
                                          'name': {'indexed': True,
                                                   'type': 'STRING',
                                                   'unique': True},
                                          'type': {'indexed': True,
                                                   'type': 'STRING',
                                                   'unique': False}}},
            'SemmedTriple': {'count': 3428531,
                             'properties': {'count': {'indexed': False,
                                                      'type': 'INTEGER',
                                                      'unique': False},
                                            'id': {'indexed': True,
                                                   'type': 'STRING',
                                                   'unique': True},
                                            'object_id': {'indexed': False,
                                                          'type': 'STRING',
                                                          'unique': False},
                                            'object_name': {'indexed': False,
                                                            'type': 'STRING',
                                                            'unique': False},
                                            'object_type': {'indexed': True,
                                                            'type': 'STRING',
                                                            'unique': False},
                                            'predicate': {'indexed': False,
                                                          'type': 'STRING',
                                                          'unique': False},
                                            'subject_id': {'indexed': False,
                                                           'type': 'STRING',
                                                           'unique': False},
                                            'subject_name': {'indexed': False,
                                                             'type': 'STRING',
                                                             'unique': False},
                                            'subject_type': {'indexed': True,
                                                             'type': 'STRING',
                                                             'unique': False}}},
            'Tissue': {'count': 53,
                       'properties': {'tissue': {'indexed': True,
                                                 'type': 'STRING',
                                                 'unique': True}}},
            'Variant': {'count': 88176,
                        'properties': {'name': {'indexed': True,
                                                'type': 'STRING',
                                                'unique': True}}}}}